Hücrelerin yönetim ve katılım merkezi olan çekirdek, hiyerarşik ve kimyasal bir yapıdır ve hücre zarıyla benzerlik gösterir. Çekirdek zarı, çekirdeği sitoplazmadan ayıran lipoprotein yapısında çift tabakalı bir oluşumdur. Bu zar, hücrenin yönetim ve kontrol mekanizmasını oluşturur ve hücrelerin bölünmesini, büyümesini, onarılmasını ve canlılık faaliyetlerinin devamını sağlar. Sitoplazma içerisinde yer alan en büyük yapıdır ve sitoplazmadan daha büyük ve koyu renkli bir özelliktedir.

Çekirdek dört ana kısımdan oluşur:

Çekirdek Zarı: Yapısal olarak hücre zarı gibi çift katlı bir yapıya sahiptir. Üzerinde bulunan deliklere por denir ve bu porlar hücre zarındaki porlardan daha büyüktür. Hücre bölünmesi esnasında kaybolan bu zar, bölünme işleminden sonra endoplazmik retikulum ve Golgi aygıtı tarafından yeniden inşa edilir. Çekirdeği sitoplazmadan ayıran bu zar, dışarıda bulunan zarla endoplazmik retikuluma bağlanır ve çekirdek zarının üzerinde maddelerin geçişini sağlayan porlar bulunur. Sitoplazma ile çekirdek zarı arasında besin alışverişini sağlar.

Çekirdek Özsuyu: Özellik olarak sitoplazmaya benzeyen bu yapı içerisinde besinleri ve nükleik asitleri barındırır.

Çekirdekçik: Çekirdek özsuyunun içerisinde bulunan ve bu özsuyu yoğunlaştırarak saydamlaşmasını sağlayan yapıdır. Hücrelerin bölünmesi esnasında eriyerek kaybolur. Bir veya birden fazla olabilir. Yapısının içerisinde RNA ve protein bulunur.

Kromatin İplikler: Çekirdeğin içerisinde ağ şeklindedir. Hücrelerin bölünmesi esnasında kısalır, kıvrılır ve kalınlaşır. Böylelikle kromozomları oluşturur. Kromozomların yapısında DNA ve proteinler bulunur. Kromozomlar içerisinde yer alan genler, canlıların yapısal özelliklerini nesilden nesle taşır. Bu sayede insanların üremesiyle oluşan bebekler aynı genleri taşır. Her hücrede çekirdek bulunmaz; buna en güzel örnek alyuvarlardır. Çekirdeği olmadığı için bölünemezler.

Hücre çekirdeği yani nükleus, tanecikli ve lifli bir yapıya sahiptir. Hücrenin organelleri, vücut için organ ne ise hücre için de o işlevi görür ve karmaşık yapıya sahip ökaryot hücrelerde birçok organel bulunur. Bu organeller mikroskopla gözlemlenebilen yapılardır.

Hücrelerin yapılarında bulunan çekirdek sayesinde hücrelerin gelişimi ve ayrışması sağlanır. Çekirdek hücrenin en küçük parçasıdır ve insan vücudunun oluşmasında kritik bir rol oynar. Çekirdek zarının hücre içerisindeki varlığını araştıran bilim adamları, bu yapıyı bilimsel olarak kanıtlamışlardır. Ancak insan bedeninde hala bilinmeyen birçok yapı ve değişim mevcuttur.